中国土拉弗朗西斯菌数目可变串联重复多态性位点特有重复数的研究

Chinese Journal of Vector Biology and Control(2015)

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摘要
目的 采用多位点可变数目串联重复分析(MLVA)方法研究中国土拉弗朗西斯菌(土拉菌)的遗传特征.方法 根据以往文献,选取对B型土拉菌分辨力较高的12个数目可变串联重复多态性(VNTR),对10株中国土拉菌和29株已公布测序的参考菌株进行MLVA分型研究.结果 MLVA分析显示,中国菌株在4个VNTR位点具有特有的重复数:Ft-M3重复数是5,Ft-M18重复数是1,Ft-M20重复数是2,Ft-M21重复数是2.12个VNTR位点组合分析,得出重复数比较接近的是:410108和日本FSC022;410112、410113和德国F92;410116、410117和美国OSU18、俄罗斯LVS.结论 根据特有的重复数,通过检测Ft-M3、Ft-M18、Ft-M20和Ft-M21位点,可以把中国本土土拉菌和国外土拉菌区分开.另外,相对于欧美国家和日本,中国土拉菌具有更多的遗传多样性.
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关键词
Francisella tularensis subsp. holarctica,Tularemia,Multiple?locus variable number tandem repeat analysis,Variable number of tandem repeats
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