哈尔滨市男男同性恋HIV-1感染者gag区基因分析

目的：了解哈尔滨市男男同性恋者（MSM）感染HIV-1流行株的亚型分布状况及基因变异情况。方法采集MSM人群中HIV感染者血液标本，提取病毒RNA并应用巢式聚合酶链反应（nested-PCR）对HIV病毒gag区基因进行扩增，并对扩增产物测序。Mega 5.1软件进行系统进化树分析及基因离散距离的计算，BioEdit 7.0.0软件将相应的基因序列翻译成氨基酸并分析其变异情况。结果成功获得61条gag基因序列，亚型分析结果显示，CRF01_AE 49例（80.32%），CRF07-BC 5例（8.19%），B亚型7例（11.47%）。其中B亚型基因离散距离最大（0.078±0.005），CRF01_AE最小（0.051±0.004）。CRF01_AE在MSM人群中形成两个独立的进化簇。各亚型的MHR序列变异对比结果显示，B亚型的中MHR序列中第7位缬氨酸（V）突变为异亮氨酸（I）的比例最大。结论哈尔滨市MSM人群中主要存在CRF01-AE、CRF07-BC和B三种亚型，以CRF01-AE为主要流行亚型；其中B亚型基因变异程度最大。对MSM人群HIV-1流行及变异情况的监测有助于对MSM人群开展及时有效的治疗。