哈尔滨市男男同性恋HIV-1感染者gag区基因分析
Chinese Journal of Experimental and Clinical Infectious Diseases(2015)
摘要
目的:了解哈尔滨市男男同性恋者(MSM)感染HIV-1流行株的亚型分布状况及基因变异情况。方法采集MSM人群中HIV感染者血液标本,提取病毒RNA并应用巢式聚合酶链反应(nested-PCR)对HIV病毒gag区基因进行扩增,并对扩增产物测序。Mega 5.1软件进行系统进化树分析及基因离散距离的计算,BioEdit 7.0.0软件将相应的基因序列翻译成氨基酸并分析其变异情况。结果成功获得61条gag基因序列,亚型分析结果显示,CRF01_AE 49例(80.32%),CRF07-BC 5例(8.19%),B亚型7例(11.47%)。其中B亚型基因离散距离最大(0.078±0.005),CRF01_AE最小(0.051±0.004)。CRF01_AE在MSM人群中形成两个独立的进化簇。各亚型的MHR序列变异对比结果显示,B亚型的中MHR序列中第7位缬氨酸(V)突变为异亮氨酸(I)的比例最大。结论哈尔滨市MSM人群中主要存在CRF01-AE、CRF07-BC和B三种亚型,以CRF01-AE为主要流行亚型;其中B亚型基因变异程度最大。对MSM人群HIV-1流行及变异情况的监测有助于对MSM人群开展及时有效的治疗。
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关键词
Men who have sex with men,Gag gene,HIV-1 subtype
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![](https://originalfileserver.aminer.cn/sys/aminer/pubs/mrt_preview.jpeg)
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