云南HPV-16型E6、E7基因的突变分析

人乳头瘤病毒(Human papillomavirus,HPV) 16型(HPV-16)是引起宫颈癌的一种主要高危型病毒,其2个致癌基因E6和E7的核酸序列变异可能会影响其对宿主细胞的致癌性,已有研究表明其序列突变呈现地域差异性.因此,研究不同地域HPV-16这2个基因的变化情况是宫颈癌流行病学调研的主要内容,也可为研究E6和E7的致癌性积累数据.研究以NCBI登录号为NC_001526.2的HPV-16型病毒的序列为参照,采用Neighbor-joining方法对云南地区74例HPV-16样本的E6、E7的DNA序列构建进化树,结果显示:只有亚洲和欧洲变异亚型,而没有发现非洲1、非洲2、亚-美洲和北美洲这4种变异亚型.DNA序列分析显示:E6的碱基突变以T178G(D25E,59,46％)和T350G(L83V,8.11％)为主,E7的碱基突变主要以A647G(N29S,59.46％)和T846C(同义突变,60.81％)为主.发现E6的新突变有A95G(同义突变,1.35％)和A135G(K11R,1.35％);E7的新突变有C625T(L22F,1.35％)、C627T(同义突变,12.16％)、G689A(G43E,1.35％)、T748G(S63A,1.35％).此外还发现有一个共突变现象:T178G(D25E,59.46％)-A647G(N29S,59.46％)-T843C(同义突变,21.62％)-T846C(同义突变,60.81％).