GMPS,PR,CD40和p21对卵巢癌预后的预测价值(Prognostic values of GMPS,PR CD40,and p21 in ovarian cancer全译)
PEERJ(2019)
Abstract
目的 通过一个卵巢癌自发恶性转化模型来识别卵巢癌患者的预后标志物.方法 小鼠卵巢表面上皮细胞(MOSECs)在体外培养可以发生自发恶性转化.使用Illumina HiSeq 2000新一代测序平台和生物信息学分析检测在此模型转化过程中的基因表达和信号传导的改变.使用基因表达互作谱分析(http://gepia.cancer-pku.cn/)识别4个差异表达的核心基因,随后使用TCGA数据库与Kaplan-Meier Plotter在线数据库(www.kmplot.com)研究这些核心基因与卵巢癌患者生存期之间的关系.结果 数据显示在MOSECs自发恶性转化的初期与晚期差异表达的基因共计263个,其中包括182个上调与81个下调基因.生物信息学数据揭示有4个基因(GMPS、PR、CD40、p21)在卵巢癌发生过程中扮演者重要的角色.此外,使用TCGA数据验证了这4个基因的差异表达及其与卵巢癌患者的预后相关.结论 本研究使用卵巢癌进展模型分析差异表达的基因,并鉴定出四种(即GMPS、PR、CD40和p21)基因可以作为卵巢癌患者的预后标志物.未来需要前瞻临床研究来进一步验证这四种基因的特征及其临床实用性.
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Key words
Ovarian cancer,Gene profiling,Biomarker,TCGA dataset,Prognosis
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