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1996-2014年中国HIV-1毒株CRF01_AE亚型传播簇和传播网络研究

Zhonghua liu xing bing xue za zhi = Zhonghua liuxingbingxue zazhi(2019)

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Abstract
目的 了解我国HIV-1毒株CRF01 AE亚型在省内和省际的传播规律和风险因素,为实施精准干预提供参考依据.方法 收集我国19个省份1996-2014年已有的2 094条CRF01_AE pol区基因序列,利用PhyML 3.0软件构建系统进化树,确定传播簇,利用Cytoscape 3.6.0软件构建传播网络,结合背景信息分析传播风险.结果 发现82个传播簇,包含255条序列(12.18%,255/2 094),省内传播簇数量和包含序列数(61个,173条)明显多于跨省传播簇(21个,82条).传播簇中男男性传播人群的成簇比例随时间上升趋势明显,由1996-2008年的2.41%(2/83)上升为2013-2014年的23.61%(72/305)(x2=27.800,df=1,P=0.000).跨省传播簇的男男性传播人群比例明显高于省内传播簇,由1996-2008年的0.67%(2/297)上升为2013-2014年的6.36%(30/472),具有随时间的上升趋势(x2=20.276,df=1,P=0.000).跨省传播簇中男男性传播的比例(86.59%,71/82)明显高于省内传播簇(56.65%,98/173),差异有统计学意义(x2=22.792,P=0.000).含2种及以上传播途径的跨省传播簇的比例(33.33%,7/21)明显高于省内传播簇(13.11%,8/61),差异有统计学意义(x2=4.273,P=0.039).传播网络分析发现,跨省传播簇内高传播风险人群比例(51.22%,42/82)明显高于省内传播簇(26.59%,46/173),差异有统计学意义(x2=14.932,P=0.000).跨省传播簇以男男性传播人群为主.结论 我国HIV-1毒株CRF01_AE亚型存在复杂的传播网络,跨省传播簇快速增长,其中高风险传播者对HIV-1亚型的大范围传播起到重要作用,应深入进行传播网络研究以指导精准干预.
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CRF01_AE subtype,HIV-1,Transmission cluster,Transmission network
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