浙江省啮齿动物中温州病毒的基因组学分析

目的 为了解国内发现的新型沙粒病毒(温州病毒)在温州地区啮齿类动物中的流行情况.方法 采用巢式RT-PCR方法分别对采集自温州(48份)及龙泉(156份)的啮齿动物样本筛查沙粒病毒.结果 在温州地区采集的5份啮齿动物样本中再次检测到温州病毒,阳性率为10.41％;但在龙泉地区采集的156份样本中均未发现温州病毒.分析病毒的全基因组序列发现其中4株病毒与已知的温州病毒有很高的同源性;而编号为Wencheng-Rn-288病毒株的S和L节段与已知病毒同源性分别为87.5％和91.6％,在进化树上为一独立分支,为温州病毒的新亚型.结论 温州病毒在温州地区啮齿动物中有较高的流行率,且呈多样性.鉴于在柬埔寨已发现温州病毒能引起人呼吸道疾病,因此我国应加强温州病毒的监测.