黄精属6种植物的SSR遗传差异分析
Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica(2018)
Abstract
黄精属Polygonatum为百合科Liliaceae多年生草本植物,在食品、医药等领域具有广阔的应用前景.该研究通过简单重复序列分子标记(simple sequence repeat,SSR)分析探讨了黄精属6种植物的遗传差异性和群体结构.从我国14个省38个县市共收集60份材料黄精属种质资源,利用49对SSR引物进行遗传差异性和群体结构的分析,结果显示:49对SSR引物共检测到211个等位基因,平均每个标记扩增得到4.306 1个等位基因,变化范围为2~10个;多态性信息含量的变异范围0.031 7 ~0.731 8,平均为0.3096;聚类结果分析显示,60份黄精属种质材料在遗传距离阈值为0.26时可聚为4大类,其中大部分具有亲缘关系的同种材料聚为一类,但有6份材料并没有和同种的其他材料聚在一起,显现出种间交叉及地理分布交叉现象.4个地区来源群体间的遗传多样性指数从大到小排列依次为西部地区>华中地区>华南地区>华东地区.群体结构分析表明,当K为4时,60份材料可分为4个类群,且与SSR聚类分析结果有一定的相似性.以上结果表明,黄精属植物遗传多样性丰富,变异幅度大,种的界限相对模糊,互生叶系与轮生叶系的某些植物存在差异减小的现象;西部地区的遗传多样性较其他地区高,可能是我国黄精属植物的起源中心.
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Key words
Polygonatum,SSR molecular marker,genetic diversity,germplasm resources,population structure
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