Identifizierung polybakterieller DNA im Aszites mittels Nachweis und Charakterisierung von 16S rRNA Gensequenzen

Hintergrund: Die spontane bakterielle Peritonitis (SBP) ist eine schwerwiegende Komplikation bei Patienten mit Leberzirrhose, deren Prognose durch eine schnelle und gezielte Antibiotikatherapie positiv beeinflusst werden kann. Da der Nachweis einer bakteriellen Infektion mittels kulturabhängiger Methoden teilweise unzuverlässig ist, wird eine SBP auch ab einem Wert von 500 Leukozyten/µl Aszites und negativem Kulturbefund antibiotisch therapiert. In dieser Studie wurde die kultivierungsunabhängige 16S rRNA Genamplifikation für einen schnellen Nachweis von bakterieller DNA (baktDNA) im Aszites etabliert. Positive Aszitesproben wurden anschließend mittels Terminaler Restriktionsfragment-Längenpolymorphismen (T-RFLP) und direkter Sequenzierung charakterisiert.