ESTANDARIZACIÓN DE LA TÉCNICA RT-PCR TIEMPO REAL PARA LA DETECCIÓN DEL VIRUS DE LA NECROSIS PANCREÁTICA INFECCIOSA (VNPI) EN TRUCHAS ARCO IRIS (Oncorhynchus mykiss).
Revista de Investigaciones Veterinarias del Perú(2012)
摘要
El objetivo del presente estudio fue estandarizar y validar la tecnica de RT-PCR tiempo real para el diagnostico del virus de Necrosis Pancreatica Infecciosa (VNPI) en truchas arco iris ( Oncorhynchus mykiss ) de la sierra central del Peru. Se colectaron mues- tras de rinon y bazo de truchas con aparentes signos clinicos de necrosis pancreatica infecciosa (NPI) (n= 61) y truchas aparentemente sanas (n= 60) de dos piscigranjas del valle del Mantaro, Junin. Previo a la estandarizacion, las muestras fueron procesadas para la deteccion de antigeno del VNPI por inmunofluorescencia indirecta (IFI). Diez muestras de rinon y bazo de truchas negativas al VNPI por IFI fueron inoculados con una cepa del VNPI con titulo de 10 3 UFP/ml. La extraccion del acido nucleico del VNPI de las 121 muestras de rinon y bazo y de las 10 muestras de rinon y bazo inoculadas con el VNPI, la sintesis del ADN complementario y la RT-PCR tiempo real se realizaron utilizando kits comerciales. Se usaron los cebadores WB1 y WB2 correspondientes a un segmento del gen que codifica la proteina VP2 de los Aquabirnavirus. Una cepa del VNPI fue utilizada como control positivo y cepa de Rotavirus A, virus de Gumboro, virus de diarrea viral bovina, parainfluenza 3 como controles negativos. Las 121 muestras de rinon y bazo de las truchas arco iris resultaron negativas al VNPI por IFI. Los resultados de la RT-PCR en tiempo real fueron determinados en funcion a los valores del ciclo de amplificacion que fue de 31.7 y temperatura de disociacion de 80.4 °C de los productos del virus control positivo. La tecnica de RT-PCR en tiempo real fue capaz de detectar hasta una concentra- cion de 10 2 DI 50 UFP/ml del VNPI en las muestras de rinon y bazo inoculadas, mientras que las 121 muestras de truchas resultaron negativas al VNPI. La tecnica de RT-PCR en tiempo real tuvo 100% de sensibilidad y especificidad en la deteccion del virus de
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