粗山羊草全基因组 Aux/IAA 基因家族的分离、染色体定位及序列分析

Acta Agronomica Sinica(2014)

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摘要
生长素是植物生长发育过程中的关键激素之一, Aux/IAA 家族基因是重要的生长素原初响应基因。通过生物信息学方法从粗山羊草(Aegilops tauschii)全基因组中分离出28个 Aux/IAA 基因,其中20个粗山羊草 Aux/IAA 蛋白具有4个保守结构域;28个 Aux/IAA 基因分布于全部7对染色体上,5个基因分别具有位于同一位点的已知标记。粗山羊草 IAA3、IAA11和 IAA26的表达具有组织特异性,分别在雌蕊、种子和根中特异表达。系统发育显示,11对粗山羊草-乌拉尔图小麦 Aux/IAA 蛋白、5对粗山羊草-大麦 Aux/IAA 蛋白直系同源。共线性分析表明,粗山羊草 Aux/IAA基因与短柄草、水稻中同源基因具有很好的共线性。本研究分离的相关基因不仅可用于小麦的遗传改良,也为深入研究小麦 Aux/IAA 基因提供了信息。
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关键词
Chromosome location,Aux/IAA gene family,Auxin,Aegilops tauschii,Bioinformatics
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