Caracterização do Transcriptoma da Soja Frente à Inoculação de Nematóide Causador de Lesões Radiculares

BBR - Biochemistry and biotechnology reports(2013)

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Abstract
Os nematoides causadores de lesoes radiculares (Pratylenchus sp.) representam um dano grave para a soja e outras culturas agricolas, causando impactos economicos globais. Para identificar genes diferencialmente expressos (GDE) na interacao planta-nematoide, genotipos suscetivel (TGM 115 RR) e resistente (BRSGO Chapadoes) foram inoculados com o nematoide, Pratylenchus brachyurus, e bibliotecas de RNA-seq de raizes inoculadas em quatro diferentes tempos pos-inoculacao foram construidas. Assim, no presente estudo, foi realizada a caracterizacao do transcriptoma de dois genotipos de soja durante a interacao inicial com nematoide da lesao radicular. RNA foi extraido das raizes dos dois genotipos e sequenciado com a plataforma Genome Analyzer. Os reads single-end foram mapeados nos transcritos preditos de soja para a identificacao dos genes expressos. Um total de 1.766 e 2.464 DGE foram identificados nos genotipos resistente e suscetivel, respectivamente. Um numero maior de GDE associados a resposta ao estresse (GO) foi identificado no genotipo resistenteem relacao ao suscetivel, em todos os tratamentos.
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