SFP PC-81 – Etiologies virales des diarrhées aigües de l’enfant à Libreville

Objectifs Determiner la prevalence des virus au cours des diarrhees aigues et specifier les differents genotypes de rotavirus circulants. Sujet Etude prospective transversale realisee de fevrier a Novembre 2011, a partir d’echantillons de selles d’enfants âges de 1 mois a 15 ans hospitalises pour diarrhee, dans 3 services de pediatrie de Libreville, et chez un groupe d’enfants controle. Analyse par PCR quantitative puis sequencage a la recherche des souches circulantes de rotavirus. Resultats Au total 426 patients hospitalises et 113 enfants temoins ont ete inclus. Une sequence genomique virale a ete detectee chez 286 patients (67%). Le rotavirus A etait majoritaire (56,2%), suivi des adenovirus (22,8%), sapovirus (8,5%), norovirus 1 (7,1%), norovirus 2 (3,1%) et astrovirus (1,8%). Dans le groupe controle 63,7% (n=72) etaient negatifs pour les 6 virus testes, chez les 41 porteurs sains on a retrouve 88,9% d’adenovirus et 11,1% de norovirus 2. Le sequencage des fragments specifiques du rotavirus a revele 3 genotypes G1 (57,0%), G12 (36,0%) et G3 (7,0%). Conclusion Rotavirus A est fortement associe aux diarrhees aigues de l’enfant hospitalise a Libreville. La diversite et la variabilite genetique des rotavirus laissent presager l’emergence de nouvelles souches (G12)