绵羊肺腺瘤病毒内蒙古分离株前病毒全基因组克隆及序列分析

为了探究绵羊肺腺瘤病毒(Jaagsiekte sheep retrovirus,JSRV)内蒙古流行株与国际各代表株间的亲缘关系,本研究以内蒙古地区绵羊肺腺瘤病自然病例的肺组织总DNA为模板,克隆gag、pro与pol基因,并应用双酶切的方法将其与本实验室先期制备并保存的LTR、env基因连接起来,得到了含有JSRV内蒙古分离株前病毒全基因组重组质粒pMD-JSRV.序列分析结果表明,JSRV内蒙古分离株前病毒全基因组全长7 690 bp,具外源性JSRV典型的分子特征:①在gag基因中含Sca Ⅰ酶切位点;②核衣壳蛋白区有2个保守的可形成锌指结构的“CCHC”基序;③env基因编码的TM区胞浆尾部包含保守的特异性“YXXM”基序.将其进行同源性分析,结果表明该株病毒属JSRV-Ⅱ型,与分离自美国的代表株AF105220间亲缘关系较近,同源性达95％.本研究为进一步探讨JSRV内蒙古分离株基因组结构特点与其致病机制间的关系奠定了基础.