碘-125粒子照射人胃癌细胞株后的全基因组表达

目的 探讨胃癌细胞接受碘-125 (125I)粒子照射后的基因表达变化.方法 用125I粒子分别照射高分化(BGC-823)、中分化(AGS)以及低分化(NCI-N87)人胃癌细胞株.每个细胞株分为实验组(接受100 cGy125I粒子照射)和对照组(不接受照射).应用微阵列芯片检测3株细胞株被照射后全基因表达变化情况,设定检验水准(P＜0.05及表达倍数变化大于2)以筛选差异表达的基因.应用实时定量(qRT)-PCR验证差异基因表达情况,应用BisoGenet重建蛋白-蛋白相互作用网络,用Cytoscape复杂网络分析和形象化平台进行基因网络关系分析.应用DAVID进行GO及KEGG通路分析.结果 高、中、低3个不同分化细胞株经相同剂量率的125I粒子照射后,基因芯片的层次聚类分析结果显示,3株胃癌细胞株的对照组和实验组从细胞聚类分析上看是属于同一聚类,NCI-N87细胞经125I粒子照射后,有895个基因表达上调,786个基因表达下调;AGS细胞经125I粒子照射后,有124个基因表达上调,161个基因表达下调;BGC-823细胞经125I粒子照射后,有2 412个基因表达上调,3 243个基因表达下调.电离辐射后会引起非常复杂的转录调控变化,KEGG通路分析说明这些差异表达基因在特定的细胞通路中有重叠.经qRT-PCR验证其中具有相似动力学特性的差异表达基因TRAF3IP2-AS1、SDC1、RABL2B和NOM1 4个基因,与对照组相比均出现了差异表达(P＜0.05).结论 125I粒子照射胃癌细胞株后会导致较多基因表达上调或下调,其中TRAF3IP2-AS1、SDC1、RABL2B和NOM1在3株细胞株均发生显著变化,推测可能是125I粒子治疗胃癌的作用点,为将来研制治疗胃癌靶向药物提供参考.