呼吸道合胞病毒G蛋白基因序列分析

目的 了解2010年四川地区呼吸道合胞病毒(HRSV)G蛋白基因特征和优势型别.方法 RT-PCR方法扩增18例呼吸道感染HRSV阳性患儿样本HRSV G蛋白基因,测序并分析G蛋白基因特征,构建系统进化树鉴定基因型,分析选择压力.结果 所测G蛋白基因第二个高变区序列7例A亚型和11例B亚型核苷酸基因距离分别为0.022士0.005和0.073±0.010,碱基转换率大于颠换率,A和B亚型分别主要是GA+ AG和UC+CU转换.系统进化分析A亚型全部为GA2基因型,B亚型为BA基因型和GB2基因型;A亚型G蛋白基因长度都为298aa,B亚型为295aa、312aa和315aa3种长度.A、B亚型的选择压力为净化选择占主导,第二个高变区A亚型有9个正选择位点,B亚型有1个正选择位点.结论 2010年四川18例HRSV以GA2、GB2和BA基因型为主要型别,G蛋白基因长度变化、碱基替换、选择压力是HRSV逃避免疫反应的原因.