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HLA新等位基因A*33:44序列分析

Haoqiang Ding,Xin Ye,Yingfeng Huang,Yuan Shao,Yangkai Chen,Wenjie Xia,Baiyu Xiong

Zhonghua yi xue yi chuan xue za zhi = Zhonghua yixue yichuanxue zazhi = Chinese journal of medical genetics（2014）

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Abstract
目的 鉴定1例人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)新等位基因.方法 应用双链及单链测序法进行基于序列的分型(sequence based typing,SBT),通过群体调查了解该等位基因的群体分布频率.结果 该等位基因HLA-A* 33:44,与A*33:03:01第4外显子相差1个核苷酸,使第866位碱基由G变为A,第265个密码子由GGT变为GAT,相应氨基酸由甘氨酸变为天门冬氨酸.与IMGT/HLA数据库中的HLA-A等位基因的序列进行对比,该突变为新的单核苷酸多态性位点.结论 该新HLA等位基因在中国汉族人群中的分布频率小于0.0003,并被世界卫生组织HLA因子命名委员会命名为HLA-A* 33:44(序列注册号为HQ873871).研究新等位基因的序列可为HLA基因相关研究和应用提供信息.
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Key words
HLA-A antigen,Alleles,Genome,Sequence analysis,Exon,Mutation
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