2007-2011年青岛地区H3N2流感病毒全基因组进化特征分析

目的 了解2007-2011年青岛地区流行的H3 N2流感病毒的全基因组进化特征.方法 选取2007-2011年青岛地区流行的H3 N2流感病毒58株,提取病毒RNA,应用RT-PCR扩增各基因片段,并进行序列测定；用Sequencher软件完成序列拼接.选取GenBank收录的全球同期氨基酸数大于300的H3 N2流感病毒589株,以其血凝素重链区(HA1)序列作为参照,用Mega 5.0软件对各基因片段进行系统发育分析及分子特征分析.结果 2007-2011年青岛地区流行的H3 N2流感病毒血凝素(HA)基因在进化树上形成单一主干,每一流行季毒株的起源均晚于上一季；全基因组进化分析发现,2009-2010流行季存在重配病毒株,而2010-2011流行季同时存在簇Ⅰ和簇Ⅱ两系毒株流行,该季病毒呈现复杂的重配现象.病毒HA1蛋白与疫苗株比较,2007-2011年各监测季分别有8、6、6、8、11处氨基酸变异,涉及13个抗原位点.M2蛋白氨基酸序列分析表明,分离到的H3N2流感病毒31位氨基酸均发生丝氨酸→天冬酰胺(S31N)突变.2007-2011年青岛地区分离的H3N2流感病毒HA1基因在进化树上与全球同期H3 N2流感毒株处于同一主要分支.序列比对及抗原性分析显示,毒株A/Qingdao/F521/2011存在H3 N2与甲型H1N1流感病毒共感染现象.结论2007-2011年青岛地区流行的H3N2流感病毒各基因片段呈现复杂的进化特征.