青岛地区2007-2009年人肠道病毒71型的分子流行病学研究

目的 了解2007-2009年青岛地区引起手足口病的人肠道病毒71(EV71)型VP1基因编码区(CDS)分子流行病学特征.方法 采用荧光定量PCR对咽拭子标本进行总肠道病毒(EV)、柯萨奇病毒A16(CA16)和EV71检测.选取部分EV71检测阳性的标本进行VP1基因CDS序列的扩增及测序,对所获得的序列进行进化树分析.结果 青岛市2007-2009年的51株EV71病毒核苷酸和氨基酸的差异性分别为5.3%和1.7%.所有病毒均属于C4亚型中的C4a簇.2008和2009年的基因进化树均有多个分支产生,但每年都有一个主要分支(即优势株).2008年的优势株与2007年山东省临沂市优势株高度同源,2008年的次优势株和2009年的优势株同与2008年安徽省阜阳市优势株高度同源.2007年的2株EV71与2007年山东省临沂市流行株高度同源.结论 青岛市2008和2009年的EV71均有多个传播链存在,2008年的主传播链至2009年变为次传播链,但2008年的次传播链至2009年发展为主传播链.