结缔组织生长因子受体结合区域的预测及筛选

Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition(2012)

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Abstract
目的 分析结缔组织生长因子(connective tissue growth factor,CTGF)二级结构,进行其受体结合区域的预测及筛选.方法 利用生物信息学手段,分析CTGF二级结构、亲水性以及其它部分物理性质,预测和筛选出CTGF与受体的可能结合区域,为以后人工合成小分子多肽的CTGF拮抗剂做出初步筛选.结果 通过对CTGF二级结构、相应同源蛋白对比、以及亲水性和抗原性分析结果显示,CTGF与其受体结合的位点可能位于96~102、104~112、257~272区段,它们的氨基酸序列分别是TAKDGAP、IFGGTVYRS和IRTPKISKPIKFELSG.结论 初步筛选出CTGF受体结合位点,为根据其3个氨基酸序列合成CTGF拮抗剂提供了工作基础.
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Connective tissue growth factor,Fibrosis,Secondary structure,Transforming growth factor-β
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