紫花苜蓿几丁质酶Class Ⅰ基因cDNA全长克隆及序列分析

依据NCBI中已登录的截形首蓿(Medicago truncatula)几丁质酶基因的一段EST序列(GenBank登录号:AF167323)设计引物,以紫花苜蓿(Medicago sativa L.)为试验材料,利用RACE技术进行cDNA全长克隆.利用生物信息学软件对该序列进行分析得知:该基因全长1 132bp,其中含有1个930bp的开放阅读框,编码309个氨基酸.分子质量为33.538ku,等电点pI为5.258,是一个酸性蛋白且分泌到胞外.将该基因命名为MsChi I(GenBank登录号为HM224449).聚类分析显示:它与其他已知植物Class Ⅰ类几丁质酶基因具有高度的同源性;结构分析表明:该蛋白的二级结构中ρ螺旋、延伸链、β转角和无规则卷曲分别占25.89%、10.68%、4.21%、59.22%;功能分析可知:该蛋白为亲水性非跨膜蛋白,属于几丁质酶第19家族.