早期胃癌微小RNA表达谱的建立

Military Medical Journal of South China(2013)

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摘要
目的建立早期胃癌微小RNA表达谱,为临床胃癌早期诊断提供研究素材。方法收集作者医院44例早期胃癌及42例正常胃黏膜临床样本,选取其中18例(9例早期胃癌和9例正常胃黏膜样本)用于人类微小RNA芯片制备。采用生物信息学算法SAM(significant analysis of microarray)比较早期胃癌与正常胃黏膜组织中差异表达的微小RNA,获得早期胃癌微小RNA表达谱。进一步利用68例验证样本(35例早期胃癌和33例正常胃黏膜样本),采用实时聚合酶链反应(real-time polymerase chain reaction,RT-PCR)对所鉴定的表达谱进行验证。结果基于早期胃癌微小RNA芯片数据,作者比较分析了早期胃癌与正常胃黏膜组织中的差异表达基因,获得了14个差异表达的人类微小RNA。采用RT-PCR实验方法,验证了其中6个微小RNA(hsa-miR-196a,hsa-miR-196b,hsa-miR-18b,hsa-miR-1308,hsa-miR-148a和hsa-miR-375)的表达水平,获得了与芯片一致的结果。结论通过采用基因芯片技术,作者建立了一组由14个微小RNA组成的早期胃癌表达谱,为临床胃癌早期诊断提供了丰富的研究素材。
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关键词
Early gastric cancer,Gene expression profiling,MicroRNA,Early diagnosis
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