InsPecT的千核并行及优化

蛋白质翻译后修饰(PTMs)在复杂的生命过程中起到极其重要的调控作用,对蛋白质翻译后修饰的研究是对蛋白质结构及其功能分析的深入,也是当前蛋白质组学的重要方向。InsPecT软件由于具备盲搜索功能,在蛋白质翻译后修饰鉴定领域备受关注,但极高的计算复杂度是阻碍其广泛应用的主要障碍。本文对InsPecT软件进行并行化,并在千核环境下进行测试;此外,还在负载平衡方面和GPU加速方面进行优化。结果显示,并行效率突出,加速效果显著。