拟南芥受伤和接种根癌农杆菌GV3101对转录的影响

根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)侵染植物会引起感染细胞的基因转录发生变化。明确其间的基因转录模式,有助于揭示农杆菌的致病机理和改善农杆菌介导的遗传转化技术。本研究采用RAM(ranking analysis of microarray data)统计方法,分析拟南芥(Arabidopsis thaliana)受伤和接种农杆菌GV3101后第3小时至第6天的转录组变化,采用MapMan软件分析所得差异转录基因的功能类别与分布。结果显示,农杆菌GV3101导致4651个基因差异转录,而受伤时有3885个基因的转录发生改变,两者之间有1045个相同基因。接种农杆菌GV3101后拟南芥基础代谢相关的差异转录基因数目减少,并且使胁迫途径中植物致病相关蛋白(pathogenesis-related proteins,PR proteins)的编码基因转录变化显著,其中37个NB-LRR(nucleotide-binding site,leucine-rich repeat)型抗病蛋白(resistance proteins,R proteins)的编码基因转录水平明显下降。受伤时只有6个NB-LRR型蛋白的编码基因转录下调。研究结果表明,接种根癌农杆菌GV3101后拟南芥细胞的转录模式明显改变,抗病能力受到抑制,有利于农杆菌T-DNA的整合和致病。