Le和Tr序列对新城疫ClassⅠ毒株复制及转录水平的影响

Chinese Veterinary Science(2013)

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摘要
为了研究新城疫病毒(NDV)前导序列(Leader,Le)和尾随序列(Trailer,Tr)对病毒转录及复制水平的影响,以9a5b病毒微型基因组为平台,通过对Le和Tr序列的二级结构预测,进行了一系列的缺失、突变、替换,成功构建了6株突变型微型基因组。通过共转染、实时荧光定量RT-PCR试验表明,当Le末端9~28nt替换为Tr末端9~28nt时,并不影响病毒基因的转录复制效率,当直接缺失Le的第2个干环结构或缺失Le 25位以后序列时,显著降低了病毒基因的转录复制效率;但当缺失Tr内部42nt或26位以后的全部序列时,病毒基因的转录复制发生了终止。证明Tr序列的保守性相对于Le序列而言,在NDV复制和转录过程中发挥了更为重要的作用。
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关键词
Leader sequence,minigenome,Trailer sequence
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