人工锌指蛋白(ZFP)的设计及原核表达分析

Sheng wu yi xue gong cheng xue za zhi = Journal of biomedical engineering = Shengwu yixue gongchengxue zazhi(2008)

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摘要
本实验通过生物信息学手段人工设计了与A20基因启动子区特定靶序列特异作用的锌指蛋白结合域。首先对A20基因启动子进行了结构及功能分析,把经过分析获取的A20启动子区的目标序列提交Scrips研究院的ZF Tools在线服务器,经序列比较,成功获取了A20启动子区特定的18bp靶序列及与这一靶序列特异性作用的锌指蛋白的氨基酸序列。进一步利用生物信息学手段对获取的锌指蛋白进行了序列特征分析及结构模建。把锌指蛋白的DNA优化序列重组于原核表达载体pTYB11上,并成功进行了原核表达。研究表明,利用生物信息学手段,人工设计特定的锌指蛋白可行,为进一步设计完整的人工转录因子,进而干预A20基因的表达奠定了基础。
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关键词
zinc finger protein promoter bioinformatics homology model prokaryotic expression
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