空间环境诱导褪色沙雷菌LCT-SM166的蛋白质组学分析
Academic Journal of Chinese PLA Medical School(2013)
Abstract
目的分析和鉴定神舟八号飞船搭载褪色沙雷菌的差异表达蛋白质。方法对神州八号飞船搭载的褪色沙雷菌LCT-SM166及地面对照组LCT-SM213进行分离并进行16sRNA鉴定,采用同重同位素相对与绝对定量(isobaric tags for relativeand absolute quantitation,iTRAQ)方法对褪色沙雷菌LCT-SM166和LCT-SM213进行蛋白质组质谱检测,分析两株菌的差异表达蛋白。结果共鉴定到1 713个蛋白质,LCT-SM166与LCT-SM213的差异蛋白组学分析发现了111个蛋白质表达的改变,其中29个蛋白表达上调,91个蛋白表达下调。基因本体论(gene ontology,GO)功能富集分析显示大多数差异蛋白质主要与能量代谢有关。结论空间环境可影响褪色沙雷菌大量蛋白质的表达,差异表达蛋白主要分布在代谢相关过程。空间诱变菌株的蛋白质组学研究为后续贯穿组学的研究奠定基础。
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Key words
space environment,transomics,isobaric tags for relative and absolute quantitation,Serratia marcescens,proteomics
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