苏云金芽孢杆菌肠毒素基因entFM的定位与序列分析

为明确BtWB9肠毒素基因entFM在基因组中的位置及该基因的特性,以entFM基因片段制备探针,通过Southern杂交,分别对染色体DNA和质粒DNA进行基因杂交定位;以PCR方法克隆了BtWB9、1072、TS16及Bc6A1entFM基因ORF序列,并运用生物信息学工具进行了核苷酸序列与推导氨基酸序列分析。基因定位结果表明,BtWB9的entFM基因位于染色体上;基因序列分析表明,WB9entFM基因的ORF序列共由1281个核苷酸组成,可编码426个氨基酸。由基因序列推导的氨基酸序列分析显示,WB9、TS16、1072与BcCx5之间主要差异在于BcCx5的EntFM氨基酸序列在39～42位置多出QTQT(谷氨酰胺-苏氨酸-谷氨酰胺-苏氨酸)4个氨基酸,在96～99位置还有SWDK4个氨基酸的差异,而其相似性都在92%以上。