辽宁省PRRSV LN/0901株ORF5基因遗传变异分析及其抗原位点预测

根据已发表的PRRSVORF5基因序列设计引物,经RT-PCR对辽宁省PRRSV LN/0901株ORF5基因片段进行扩增、克隆及测序,结果得到长度为739bp的ORF5基因完整序列,与已知代表毒株进行核苷酸及其编码氨基酸同源性比对和系统进化树分析,LN/0901ORF5基因序列与VR-2332株同源性达到88.6%,而与LV株,则相差甚远,仅为61.7%,表明PRRSV LN/0901病毒株为美洲型,与CBB-1-F3T、GD2007、JXA1、BJ0708等毒株同源性高达98.7%～99.5%,表明该病毒与2006年以来国内的多数流行变异株遗传关系相近。通过对PRRSV LN/0901ORF5进行氨基酸疏水性及其编码蛋白跨膜区预测分析,表明该毒株ORF5具有多个抗原优势位点,与国内其他毒株既有共同位点又有区别位点,可以做为辽宁地区开发研制PRRS基因工程疫苗的重要蛋白基因。