2010年福建省手足口病患者中柯萨奇B5病毒的序列分析

目的了解福建省手足口病患者中CVB5(Coxsackie virus B5)病毒的变异及进化特征。方法采集2010年福建省手足口病例呼吸道标本,经RD细胞分离肠道病毒。病毒分离上清用于RNA提取并经RT-PCR法鉴定病毒型别。对鉴定为其他肠道病毒(非EV71或CVA16)的病毒,扩增病毒完整VP1区,扩增产物经克隆、筛选后测序。应用Mega软件对病毒VP1序列进行比较和种系进化分析。结果从2010年福建省手足口病患者中扩增得到6株完整的VP1区序列,序列比对证实有4株CVB5病毒,其他2株为Echo9病毒。序列差异比较表明,分离自福建省的CVB5病毒一致性程度较高,在种系进化上处于独立的进化分支,而与国内其他省份或其他国家的CVB5病毒分离株比较则有较大差异。结论 2010年福建省手足口病患者中存在CVB5病毒的感染,病毒与既往其它省份分离株有较大差异,提示CVB5病毒在福建省具有独特的传播链。