欧猥迭宫绦虫谷胱甘肽转移酶1基因序列与功能的生物信息学分析

目的:预测欧猥迭宫绦虫成虫谷胱甘肽转移酶1 (Glutathione S-Transferase1,GST1)基因及其编码蛋白的结构和功能.方法:应用生物信息学方法对从欧猥迭宫绦虫成虫cDNA文库中所获基因的氨基酸组成、基本性质进行分析,同时构建其编码蛋白的系统进化树并对其抗原表位进行预测及定位;建立其编码蛋白的三级空间结构模型.结果:GST1基因编码221个氨基酸,理论分子量为25767.39Da,理论等电点为5.98,理论分子式为C1188H1786N304O330S5,具有2个完整的保守功能域;在细胞内可能发挥基因表达调控及信号转导功能,与猪带绦虫的同源一致性达53％.在进化的过程中与绦虫类亲缘较近,而与脊椎类亲缘较远.预测最有可能的3个潜在抗原表位分别位于35-46aa、87-94aa、215-221aa之间.结论:GST1基因编码的蛋白为胞质型蛋白,可能是理想的药物作用靶点及新型免疫诊断的分子靶标,为对进一步研究奠定理论基础.