Évaluation du E-test® et de la galerie ATB-PNEUMo® dans la détermination des CMI aux bêtalactamines de Streptococcus pneumoniae en pratique quotidienne

En 1999, dans le cadre de la surveillance de la résistance de S. pneumoniae aux antibiotiques, les 877 souches oxacilline < 26 mm (5 μg) ou de sensibilité diminuée à la pénicilline (PSDP) ont fait l'objet d'une détermination des CMI à trois β-lactamines par E-test® pour 220 souches, ou par ATB-PNEUMO® pour 657 souches dans les 31 centres collaborateurs de la région Rhône-Alpes. Ces souches étaient ensuite centralisées au site coordonnateur chargé de déterminer ces CMI par la technique de référence de dilution en milieu gélosé. La concordance à ± 1 dilution des deux tests avec la technique de référence était respectivement pour ATB-PNEUMO® et E-test® de 89 % versus 84 % pour la pénicilline (différence non significative), de 86 % vs 79 % pour l'amoxicilline (p < 0,01) et de 91 % vs 86 % pour le céfotaxime (p = 0,03). Lors de la catégorisation thérapeutique, les différences étaient significatives (p < 0,001) pour amoxicilline (85 % vs 71 %) et céfotaxime (82 % vs 75 %) mais pas pour la pénicilline (73 % vs 78 %). La méthode de l'erreur standard avec transformation angulaire a été utilisée pour comparer la sensibilité et la spécificité des deux méthodes lors de la catégorisation thérapeutique des souches. La méthode ATB-PNEUMO® est plus sensible que le E-test® pour la détection des souches sensibles à P (90 vs 73 %), à AMX (83 vs 78 %) et au CTX (80 vs 72 %) et pour les souches intermédiaires à AMX (90 vs 78 %). Elle est aussi plus spécifique que le E-test® pour les souches AMX-S (85 vs 53 %) et CTX-S (72 vs 42 %). En revanche, le E-test® est plus spécifique que ATB-PNEUMO® pour la détection des souches Péni-R (94 vs 86 %). Le nombre de souches CTX-R étant trop restreint, la sensibilité et la spécificité n'ont pu être déterminées. Enfin, la spécificité des deux méthodes est équivalente pour la détection des souches Péni-S, AMX-R et CTX-I.