一株埃可病毒12型病毒分离鉴定及其VP1基因特征分析

目的分离并鉴定2010年昆明市无菌性脑膜炎的病原埃可病毒12型(ECHO12)病毒株F343/KM/2010,分析其VP1基因遗传特征,为病毒性脑炎的防控提供科学依据。方法采用RD细胞和Hep-2细胞对15份疑似无菌性脑膜炎患者粪便样品进行分离,经微量中和试验对该分离株进行鉴定,通过RTPCR法扩增病毒VP1基因和测序,并采用MEGA5.05等软件进行进化树和同源性分析。结果 9份样品出现细胞病变效应,其中F343/KM/2010分离株经微量中和试验定型为ECHO12病毒;经RT-PCR法扩增获得873bp的VP1基因,与国内外11株ECHO12病毒分离株核苷酸和氨基酸的同源性为81.4%~92.8%和97.6%~99.3%,其中与国内分离株的核苷酸和氨基酸同源性为89.5%~92.8%和98.3%~99.5%。F343/KM/2010株与原型株Travis比较在氨基酸上有8个位点发生突变,而与中国株比较主要在第288位点上发生了突变。在进化树上与国内分离株属于同一个分支,而国外分离株分属其他两个不同的分支。结论 F343/KM/2010分离株为肠道病毒ECHO12病毒,与中国其他分离株同属一个分支。