骨肉瘤中DNAzymes针对ezrin mRNA作用靶点筛选及体外验证

目的对Ezrin mRNA的4个DNAzymes靶点AU1655、AU1751、AU1766、AU1789通过体外实验进行验证,寻找最佳的作用位点。方法同时使用RNAdraw、RNAstructure和OligoWalk 3个程序对Ezrin mRNA的DNAzymes靶点进行了设计和筛选,对最终选出的4个位点AU1655、AU1751、AU1766、AU1789进行实验研究。结果 4个DNAzymes分别命名为Dz1655、Dz1751、Dz1766和Dz1789,酶切反应结果只有Dz1751在预期的位点成功切割了ezrin全长的mRNA,得到了128 bp和1 633 bp两个片段,其他3个DNAzymes均未能有效地完成切割;反应后所剩留底物RNA中位点AU1751最少,位点AU1751是DNAzymes切割ezrin mRNA的最佳位点。结论核酸二级结构联合热动力学参数可以最大程度预测和设计DNAzymes针对ezrin mRNA的作用位点。