广东地区结核分枝杆菌利福布丁耐药株rpoB全基因序列突变特征

Chinese Journal of Zoonoses(2011)

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摘要
目的 分析广东地区结核分枝杆菌利福布丁耐药株rpoB全基因序列突变特征.方法 常规比例法检出100株结核分枝杆菌利福布丁(rifabutin,RBU)耐药株,30株敏感株,扩增rpoB全基因序列并进行序列测定,Clustal×软件比对所测序列突变情况.结果 利福布丁敏感株rpoB基因无突变;利福布丁耐药株有24种突变类型,121个突变位点,其中106个在利福平耐药决定区(rifampin resistance determining region,RRDR)之内,15个在RRDR之外,包括3个是单点突变(V176F,P206R,H323Y)和12个联合突变;常见突变位点分别是531(70%)和526(20%);两位点联合突变率21%,单点突变率79%.结论 广东结核分枝杆菌敏感株rpoB基因不发生突变,利福布丁耐药株rpoB基因突变率100%,最常见突变位点分别是531和526.516、526和531之间不发生联合突变.RRDR之内鉴定出9种突变位点,RRDR之外鉴定出15个新突变位点,包括3个单点突变V176F,P206R和H323Y,位于rpoB基因起始端.
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关键词
rifabutin resistance,M.tuberculosis,sequence analysis,point mutation,rpoB gene
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