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一种构建细小病毒进化树的加权距离方法

Journal of Hunan University of Technology(2012)

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Abstract
应用对数关联距离与互信息距离加权的方法,对完全基因组DNA序列和蛋白质序列构建了30种细小病毒系统发育树。构建的发育树均将30种细小病毒分成细小病毒亚科和浓核病毒亚科两个大的分枝,其结构与国际病毒学分类委员会第八版报道的结果及已有文献的结果基本一致。且基于蛋白质序列构建的系统发育树比基于完全基因组DNA序列构建的要好。
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Key words
composition vector,log-correlation distance,mutual information distance,phylogenetic tree,weighted distance,complete genomes
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