基于26S rDNA D1-D3区和matK基因序列分析的阳春砂分子鉴别

[目的]建立阳春砂不同栽培品种的DNA分子鉴别方法,为阳春砂的优良品种选育提供依据.[方法]以阳春砂栽培种长果、圆果、"春选"及海南砂为材料,用相应引物对26S rDNA D1-D3区和matK基因进行聚合酶链反应(PCR)扩增和测序,对测序结果进行分析,寻找差异位点,并根据序列构建系统发生树.[结果]测序得到的26s rDNA D1-D3序列为739 bp,阳春砂与海南砂在该区域存在4个碱基位点的差异.长果阳春砂与圆果阳春砂序列相同,但它们与"春选"阳春砂存在1个碱基位点的差异,根据26S rDNA D1-D3序列建立的系统发生树揭示了"春选"阳春砂与另外2个栽培品种间的区别.测序得到的matK序列为824 bp,阳春砂3个栽培品种的matK序列相同,与海南砂存在1个碱基位,点差异.[结论]从分子水平上可鉴别阳春砂的3个栽培品种,"春选"品种比长果(或因果)品种与海南砂有着更近的亲缘关系.