9301 Identification and characterization of cancer stem cells in melanoma

EJC SUPPLEMENTS(2009)

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摘要
Atrial fibrillation (AF) affects millions of individuals worldwide. The genome-wide association studies have identified robust genetic associations with AF.We genotyped 5461 participants of Japanese ancestry for 11 AF-related loci and determined the effects of carrying different numbers of risk alleles on disease development and age at disease onset. The weighted genetic risk score (GRS) was calculated, and its ability to predict AF was determined.Six single-nucleotide polymorphisms—rs593479 (1q24 in PRRX1), rs1906617 (4q25 near PITX2), rs11773845 (7q31 in CAV1), rs6584555 (10q25 in NEURL), rs6490029 (12q24 in CUX2), and rs12932445 (16q22 in ZFHX3) (P < 1.9 × 10−5)—were confirmed as being associated with AF. Patients with a high total number of risk alleles (9-12) had a younger median age at onset of AF (58 years; 95% confidence interval [CI], 55-60 years) than those with a low total number (1-4) (63 years; 95% CI, 61-64 years) (P = 0.0015). We observed a 4.38-fold (95% CI, 3.69-5.19) difference in risk of AF between individuals with scores in the top and bottom quartiles of the GRS. Receiver operating characteristic analysis indicated an area under the curve of 0.641 (95% CI, 0.628-0.653; P < 0.0001).Six loci were validated as associated with AF in a Japanese population. This study suggests that a combination of common genetic markers modestly facilitates discrimination of AF. This is the first report, to our knowledge, to demonstrate that the age of onset of AF is affected by common risk alleles.La fibrillation auriculaire (FA) touche des millions d’individus dans le monde. Les études d’association sur tout le génome ont permis de cerner des associations génétiques fiables avec la FA.Nous avons établi le génotype de 5461 participants d’ascendance japonaise pour 11 locus liés à la FA et déterminé les effets d’être porteurs d’un nombre différent d’allèles du risque sur le développement de la maladie et l’âge à l’apparition de la maladie. Nous avons calculé le score de risque génétique (SRG) pondéré et déterminé sa capacité à prédire la FA.Nous avons confirmé l’association de 6 polymorphismes de nucléotide simple à la FA, soit le rs593479 (1q24 en PRRX1), le rs1906617 (4q25 près de PITX2), le rs11773845 (7q31 en CAV1), le rs6584555 (10q25 en NEURL), le rs6490029 (12q24 en CUX2) et le rs12932445 (16q22 en ZFHX3) (P < 1,9 × 10−5). Les patients porteurs d’un nombre total élevé d’allèles du risque (9 à 12) étaient plus jeunes à l’apparition de la FA (âge médian de 58 ans ; intervalle de confiance [IC] à 95 %, 55-60 ans) que ceux ayant un faible nombre total (1 à 4) (âge médian de 63 ans ; IC à 95 %, 61-64 ans) (P = 0,0015). Nous avons observé une différence de 4,38 fois plus grande dans le risque de FA (IC à 95 %, 3,69-5,19) entre les individus ayant des scores dans les quartiles supérieurs et inférieurs du SRG. L’analyse de la fonction d’efficacité du récepteur indiquait une surface sous la courbe de 0,641 (IC à 95 %, 0,628-0,653 ; P < 0,0001).Nous avons validé l’association de 6 locus à la FA dans la population japonaise. Cette étude suggère qu’une combinaison de marqueurs génétiques courants facilite modestement la distinction de la FA. À notre connaissance, il s’agit du premier rapport à démontrer que l’âge de l’apparition de la FA est influencé par les allèles du risque courants.
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