鹅源坦布苏病毒SHYG株E蛋白生物信息学分析

China Poultry(2013)

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Abstract
为了探索坦布苏病毒E蛋白的抗原结构,以鹅源坦布苏病毒SHYG株E蛋白基因组序列为基础,用DNAStar、Antheprot等软件对E蛋白的二级结构、亲水性、表面可能性、抗原性指数、跨膜结构及等电点等进行预测,用I-TASSER分析E蛋白三级结构。结果表明坦布苏病毒E蛋白等电点为7.15;综合分析显示37~39、80~86、124~126、133~134、233~237、276、315~318、398~399位是可能的B细胞抗原表位,其中80~86、233~237、315~318、398~399位形成抗原表位可能性更高。抗原表位的预测为坦布苏病毒E蛋白的抗原表位的鉴定提供理论依据。
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B cell epitope,Tembusu virus,prediction,E protein
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