玫烟色棒束孢几丁质酶基因上游调控序列克隆与结构预测分析

Chinese Journal of Tropical Crops(2012)

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摘要
为探明玫烟色棒束孢几丁质酶基因Ifuchi1的表达调控机理,根据Ifuchi1基因组全长核苷酸序列,采用基因组步移方法,获得Ifuchi1的5′-上游区序列(总长为2 402 bp)。与cDNA序列进行比对,其中含有2个内含子。TFSEARCH 1.3软件分析转录因子结合位点的结果显示,该序列中没有明显的TATA和CAAT框,含有4个可能的碳调控因子的结合位点5'>(g/c)YggRg<3'和3个氮调控因子的结合位点-相隔很近的GATA。其中含有可能的葡萄糖抑制调控序列和压力反应元件。本研究结果为深入研究玫烟色棒束孢几丁质酶基因的表达调控机制及其分子机理奠定了一定基础。
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关键词
Chitinase gene,Genome walking,Entomopathogenic fungi,5′-upstream region
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