实时荧光PCR检测基孔肯雅病毒方法的建立及初步应用

目的建立基孔肯雅病毒的荧光定量PCR检测方法。方法针对基孔肯雅病毒的基因序列,设计、合成引物、探针及反应体系,摸索出最佳反应条件,建立TaqMan荧光探针法和SYBR荧光染料法。利用建立的方法对30例基孔肯雅热病标本和10份基孔肯雅病毒保存液进行扩增、检测和结果分析,并与常规RT-PCR方法的检测结果进行比对。结果实时荧光定量PCR法比常规RT-PCR法快速、灵敏。40份标本TaqMan荧光探针法、SYBR荧光染料法和常规RT-PCR方法的阳性率分别为:17.5%、17.5%、15%。统计分析表明,3种方法差异不具有统计学意义。结论实时荧光定量PCR方法快速且具有较好的特异性、敏感性、重复性,适用于基孔肯雅病毒的快速检验。