尼罗罗非鱼主要组织相容性复合体IA基因克隆与多态分析
Journal of Shandong University(Natural Science)(2013)
Abstract
采用touchdown PCR和RACE技术,获得了两条尼罗罗非鱼MHC IA基因3’端的新序列,其长度均为957 bp,分别命名为orni-DAA*0101和orni-DAA*0102,其分别编码了两种新发现的等位基因亚型。两条新序列均包含666 bp的CDS区和291 bp的3’-UTR区,CDS区包含了部分多肽结合区、全部的IGC区以及跨膜区和胞质区。同源性比对显示,cDNA序列分别在388 bp和426 bp处发生了碱基转换,而其编码的氨基酸序列在第130位点存在谷氨酸与赖氨酸的差异。首次发现相对保守的IGC区也存在变异。研究结果对于揭示尼罗罗非鱼MHC IA基因的多态性及其与高抗病性的相关性有重要价值。
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Key words
polymorphism,cloning,RACE,MHC IA gene,Oreochromis niloticus
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