ProfileXpert : plateforme de génomique au service de la recherche et de la clinique

ProfileXpert est une plateforme de génomique à haut débit de l’institut fédératif des neurosciences de Lyon (IFNL), spécialisée dans l’analyse du transcriptome et du génome par les technologies des puces à ADN. ProfileXpert a été fondé en 2003, pour implémenter ces approches technologiques au sein de l’IFNL et de la région Rhône-Alpes. ProfileXpert s’est donné trois missions : proposer une offre globale de service d’analyse du transcriptome et du génome, renforcer l’activité de formation en génomique et développer une activité de transfert portant sur le développement d’outils innovants de nanogénomiques pour la recherche de marqueurs à visée médicale. ProfileXpert, animé par une équipe de spécialistes en génomique, est équipé de deux plateformes robustes de puces à ADN. ProfileXpert se caractérise par ses capacités : à assurer des services complémentaires « transcriptome et génotypage » ; à proposer une gamme étendue de puces (expression, exons, promoteurs, mapping, tiling), d’applications (analyse quantitative et qualitative du transcriptome, identification de nouveaux variants, de nouveaux transcrits, identification de pertes d’hétérozygotie, de variation du nombre de copies chromosomiques) et de génomes (homme, rat, souris, bœuf, poulet, c-elegans…) ; à analyser des microquantités d’acides nucléiques compatibles avec des échantillons cliniques (biopsies, cellules isolées, fluides biologiques) et à assurer un service d’analyse de données grâce à des logiciels spécifiques, allant du traitement d’image au data mining.