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2种三疣梭子蟹居群线粒体Cyt b和S - rRNA基因片段序列变异研究

Journal of Yantai University(Natural Science and Engineering Edition)(2008)

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摘要
目的:通过对2种三疣梭子蟹居群样线粒体Cyt b和S - rRNA基因片段的序列分析,探讨其遗传变异,为种质资源的管理、保存和利用提供依据.方法:采集山东潍坊和福建厦门两个不同居群的三疣梭子蟹样,提取其线粒体DNA.由Genebank获得三疣梭子蟹完整线粒体DNA序列(登陆号:NC_005037),设计扩增Cyt b和S - rRNA基因片段引物,经PCR扩增获得预期产物,纯化后测序.结果:以提取的线粒体DNA为模板扩增出特异性强的Cyt b和S - rRNA基因片段,与预期条带长度429 bp和465 bp吻合;2个基因片段的AT含量均高于GC含量;Cyt b基因片段有3个位点发生了突变,S - rRNA只有1个位点发生了突变;在两种居群的4个突变位点中,2个位置突变为相同的碱基,且所有突变位点均呈转换方式.结论:Cyt b基因序列比S - rRNA基因序列具有相对高的突变率;研究的2个基因片段的突变位点的碱基置换主要呈转换方式;来自2个三疣梭子蟹居群样本的线粒体S - rRNA基因的突变发生在同一位点且突变为相同碱基,表明2个居群具有较近的亲缘关系.
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关键词
Portunus trituberculatus,MtDNA,sequenc variation,S-rRNA,Cyt b
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