食管鳞癌组织及周围正常食管黏膜组织差异表达基因的筛选

目的:研究食管鳞癌组织及周围正常食管黏膜组织的差异表达基因,为寻找食管鳞癌早期诊断高敏感性,高特异性的分子指标提供理论依据.方法:分别抽提人食管鳞癌组织及周围正常食管黏膜组织总mRNA,逆转录成cDNA,用单标法以Cy3-dUTP为标记制成探针,与基因芯片进行杂交,筛选出差异表达的基因,并用生物信息学方法做进一步分析.结果:在45051个人类全基因组芯片中依Ratio实验组(癌组织)/对照组(正常食管组织)>4.0或<0.25的数据项,共发现1113条差异表达基因,其中464条上调,649条下调.经生物信息学分析,表明包含多种功能基因.RT-PCR验证其中3条基因,表达方向与芯片检测结果一致,符合预期结果.结论:在食管鳞癌的发生、发展中存在着大量异常表达基因;基因芯片是一高效筛选食管癌相关基因的方法.