禽呼肠病毒P10、P17非结构蛋白基因的克隆及序列分析

根据GenBank上的禽呼肠病毒(ARV)S1基因序列,设计并合成了一对跨越P10和P17非结构蛋白基因的特异性引物,对13个ARV毒株进行RT-PCR扩增、克隆及序列测定.结果显示,13个ARV毒株的P10蛋白基因ORF全长均为297 bp,编码98个氨基酸;P17蛋白基因ORF全长为441 bp,编码146个氨基酸.这13个ARV毒株P10、P17蛋白基因核苷酸同源性分别在96.6%～100%和95.2%～99.3%之间,推导的氨基酸同源性分别在98.2%～100%和91.9%～99.0%之间.将这13个ARV毒株与GenBank上其他正呼肠病毒毒株,包括番鸭株(DRV)和飞狐上分离到的内尔森海湾病毒(Nelson Bay virus,NBV)及两个澳洲分离株(ARM-1和SOM-4)进行同源性比较和遗传进化树分析,结果表明,呼肠病毒有地域和种类的差别.