MiR-106b在2型糖尿病db/db小鼠骨骼肌中的表达及生物信息学分析

目的 微小RNA(microRNA,miRNA)是一类小分子单链非编码RNA,广泛参与各种生物学过程,与肿瘤、糖尿病、心血管疾病关系密切,miR-106b与胰岛素抵抗糖尿病密切相关.文中检测miR-106b在2型糖尿病db/db小鼠骨骼肌中的表达,并对其靶基因进行预测及相关生物信息学分析,为 miR-106b靶基因的实验验证提供数据支持,并为深入研究miR-106b的生物学功能和调控机制提供理论指导.方法 利用实时PCR 技术检测miR-106b在糖尿病db/db小鼠骨骼肌中表达.利用miRBase、NCBI、UCSC Browser等在线工具分析miR-106b序列.把利用TargetScan和StarBase 2种计算方法预测的miR-106b靶基因的交集作为分析的基因集合,分别进行基因本体(gene ontology,GO)注释描述、GO富集分析和生物通路富集分析.结果 ①miR-106b在2型糖尿病db/db小鼠骨骼肌表达显著升高;②miR-106b在各物种之间具有高度保守性;③预测靶基因集合分别富集在代谢调节、生物合成、细胞增殖与凋亡等基本生物学过程和蛋白结合、转录调控等分子功能上(P＜0.001).经典miR-106b预测靶基因集合显著富集于KEGG通路数据库中的Wnt 信号通路、mTOR信号通路、TGF-β信号通路和胰岛素信号通路等12个信号转导通路,以及前列腺癌、慢性髓细胞性白血病、黑素瘤等12个疾病通路中(P＜0.05).结论 MiR-106b在db/db小鼠骨骼肌表达升高.miR-106b与多种肿瘤的发生和细胞周期调节有关.miR-106b参与物质代谢等过程的调控,可能在胰岛素抵抗、2型糖尿病的发病中起重要作用.