从12S rRNA部分基因序列探讨鳄的系统发生关系

本文用常规方法测定了雅卡凯门鳄(caiman yacane)、新几内亚鳄(crocodylus novaeguineae)等2种鳄类的约400bp的mtDNA12SrRNA基因片段的部分序列,所测序列与GenBank中的其他18种鳄类的12SrRNA基因相应片段同源序列一起经Clustal X 1-8软件进行比对,并以乌龟(chinemys reevesii)为外群,用ClustaIX(1.8),Mega2软件以及paup软件将这20种鳄的12SrRNA基因部分序列进行比对后构建了20种鳄的进化关系树,并分别用NJ树,MP树探讨它们之间的系统发生关系.其结呆显示:食鱼鳄属Gavialis与马来假食鱼鳄属Tomistoma的亲缘关系较近,构成姐妹群并位于鳄科分支的基部.非洲窄吻鳄(Crocodylus cataphractus)与骨喉鳄(Osteolaemus re-traspis)形成姐妹群,它们的亲缘关系比与其它真鳄类的关系更近,赞同非洲窄吻鳄应从鳄属中独立出来归属于长吻鳄属Mecistops的观点,因此鳄科包括鳄属、骨喉鳄属和长吻鳄属,它们的关系为(鳄属(骨喉鳄属,长吻鳄属)).鼍科4属中凯门鳄属与黑鳄属关系最近,接下来的是古鳄属、鼍属,而且鼍属是鼍科中起源最早的类群.扬予鳄(Alligator sinensis)与密河鳄(Alligator mississippiensis)较近的亲缘关系得到支持,但它们并没有形成姐妹群关系.