实时荧光PCR定量检测戊型肝炎病毒方法的建立
Chinese Journal of Zoonoses(2008)
摘要
目的建立灵敏、稳定、特异的实时荧光PCR方法,用于戊型肝炎病毒的定量检测。方法采用生物信息学方法,分析比对戊型肝炎病毒全序列,并针对国内流行的戊型肝炎病毒株序列,选择位于ORF2的保守区域设计引物和Taqman探针,建立实时荧光定量PCR方法。并从灵敏度、稳定性及特异性等方面对建立的方法进行综合评价。结果戊型肝炎定量检测的灵敏度为5个目的拷贝,定量的线性范围为5×(100~108)9个数量级。批内重复性检测显示其变异系数为1.49%;批间重复性检测显示其变异系数为1.98%和2.23%。对22份临床标本的检测结果显示具有良好的特异性。结论建立的实时荧光PCR方法具有灵敏度高、稳定性好、特异性强等特点,适用于戊型肝炎病毒的定量检测。
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关键词
hepatitis E virus,detection,real-time PCR,genotype
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