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研究领域:
基因组学、表观基因组学、行为遗传学
1.疾病及生命现象的基因组及表观基因组研究。本研究的长期目标是利用基因组学手段揭示控制生物学表型的遗传及表观遗传代码。首先发展全基因组水平的表观遗传密码的分析技术,包括基于新一代测序仪的全基因组DNA甲基化谱图的分析方法及组蛋白修饰分析方法。随后,利用此项技术在全基因组上分析复杂生物现象、疾病与DNA甲基化及组蛋白修饰的关系。此外,还将开发基于新一代测序仪的全外显子组测序技术,并利用此技术在全基因组水平上分析孤独症等复杂疾病与基因突变的关系。
2.疾病及生命现象的生物钟调控机制研究。在基因组、细胞及行为学水平上分析免疫与生物钟、心血管疾病与生物钟、药物成瘾与生物钟、疼痛与时间生物学的关系,了解受节律基因控制的相关生理过程的生物钟调控机制。此外,我们认为生理节律除了受生物钟基因的调控,还与组蛋白构型的24小时节律相关,因此,我们试图揭示二者之间的关系。关系。
3.表观基因组分析算法及工具的开发。人类基因组中大部分的DNA甲基化发生在重复序列(repetitive genomic sequences)区,这些区域的DNA甲基化在维持基因组稳定性过程中发挥着至关重要的作用,并可能影响了恶性肿瘤的发生发展。但是目前单碱基分辨率的DNA甲基化分析方法所产生的短序列在重复序列区的比对、定位上存在重大缺陷,我们拟在前期已成功开发甲基化可视化软件iMethy的基础上,进一步开发重复序列区DNA甲基化的分析算法和工具,提高甲基化修饰碱基的辨识率,为肿瘤基因组稳定性研究提供技术支撑。
基因组学、表观基因组学、行为遗传学
1.疾病及生命现象的基因组及表观基因组研究。本研究的长期目标是利用基因组学手段揭示控制生物学表型的遗传及表观遗传代码。首先发展全基因组水平的表观遗传密码的分析技术,包括基于新一代测序仪的全基因组DNA甲基化谱图的分析方法及组蛋白修饰分析方法。随后,利用此项技术在全基因组上分析复杂生物现象、疾病与DNA甲基化及组蛋白修饰的关系。此外,还将开发基于新一代测序仪的全外显子组测序技术,并利用此技术在全基因组水平上分析孤独症等复杂疾病与基因突变的关系。
2.疾病及生命现象的生物钟调控机制研究。在基因组、细胞及行为学水平上分析免疫与生物钟、心血管疾病与生物钟、药物成瘾与生物钟、疼痛与时间生物学的关系,了解受节律基因控制的相关生理过程的生物钟调控机制。此外,我们认为生理节律除了受生物钟基因的调控,还与组蛋白构型的24小时节律相关,因此,我们试图揭示二者之间的关系。关系。
3.表观基因组分析算法及工具的开发。人类基因组中大部分的DNA甲基化发生在重复序列(repetitive genomic sequences)区,这些区域的DNA甲基化在维持基因组稳定性过程中发挥着至关重要的作用,并可能影响了恶性肿瘤的发生发展。但是目前单碱基分辨率的DNA甲基化分析方法所产生的短序列在重复序列区的比对、定位上存在重大缺陷,我们拟在前期已成功开发甲基化可视化软件iMethy的基础上,进一步开发重复序列区DNA甲基化的分析算法和工具,提高甲基化修饰碱基的辨识率,为肿瘤基因组稳定性研究提供技术支撑。
研究兴趣
论文共 46 篇作者统计合作学者相似作者
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时间
引用量
主题
期刊级别
合作者
合作机构
Yi Li, Yue Zang,Tianda Fan, Zhaochen Li, Anzi Li,Wei Lv,Qingqing Wang,Qinglan Li,Yuanyuan Li,Quan Li,Zhongsheng Sun,Huajing Teng
Briefings in bioinformaticsno. 2 (2022)
Social Science Research Network (2022)
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