基本信息
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职业迁徙
个人简介
1. 硕士期间参与了“逆境条件下玉米苗期根系miRNA的表达与调控机理研究”,利用小RNA芯片技术鉴定高盐胁迫和低氧胁迫下诱导表达的miRNA,从中建立了miRNA与淹水、高盐逆境的关系,并进一步对miRNA参与的逆境响应通路进行了推测和分析。相关研究成果分别在2008年[5]和2009年[6]均发表于Annals of Botany杂志上。
2. 2008年以硕博连读的培养方式转入到博士期间的学习,并经郑用琏教授推荐到美国冷泉港Doreen Ware教授实验室交流学习三年,期间主要进一步深入探讨miRNA对渍水逆境的响应及其调控途径。通过高通量测序技术对miRNA的表达量进行了深入的定量分析;利用qPCR对miRNA以及其下游靶基因的表达进行了进一步的确认;分析了miRNA基因启动子区的顺式作用元件,构建了miRNA介导的、玉米根系细胞响应短期渍害胁迫的基因表达调控网络,阐述了miRNA在短期渍害逆境条件下参与的代谢及信号通路,并提出了miRNA介导的玉米根系细胞响应渍害的“节能假说”。相关研究成果以第一作者发表在PLoS One杂志上[4]。
3. 在冷泉港的三年期间,也参与了其他课题的研究工作:
1)参与了玉米基因组测序计划,构建了部分测序文库,为玉米B73全基因组测序提供了实验材料和分析数据。相关工作于2009年作为封页文章发表于Science杂志上[1]。
2)构建了5个玉米不同组织的小RNA文库,用于高通量测序。学习并参与了后期的数据分析。研究结果于2009年发表于PLoS Genetics杂志上[3]。
3)参与了拟南芥转录因子文库的构建工作中,共构建了由712转录因子所构成的转录因子文库。利用这一文库筛选了玉米以及拟南芥miRNA的启动子,构建了miRNA的调控网络。部分结果于2011年发表于Nature Method杂志上[2]。
4. 开展了玉米冠根中miRNA对长期淹水逆境胁迫响应的机理研究,参与了数据分析及论文的撰写、修改。研究结果进一步证实了所提出的miRNA介导的渍害响应“节能假说”,并以并列第一作者身份于2012年发表于Physiologia Plantarum杂志上[7]。
研究兴趣
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